医学检验大致可分为形态学、生物化学、血清免疫学和分子生物学几大类，其分别代表几代实验诊断技术。1985年Mullis发明了聚合酶链式反应（PCR ）技术，使医学界真正兴起了基因诊断技术热，成为现代医学发展的又一里程碑。随着PCR技术的不断发展，与分离培养或免疫学技术相比，其以特异性强、灵敏度高、重复性好、操作简便等特点，逐渐成为各类病原体诊断“金标准”，在常见传染病、性病、肿瘤、遗传病、寄生虫病、优生优育、法医学等广泛领域中有相当高的实际应用价值。常见的传染性疾病有细菌、病毒、衣原体、支原体等，可引起消化、呼吸、循环、泌尿生殖等不同系统相应的病变。
消化系统感染性疾病在我国具有代表性意义的有肝炎、肠道感染性疾病。引起肝炎的病原体主要包括乙型肝炎病毒（乙肝）、丙型肝炎病毒（丙肝）。PCR 法检测乙肝的优势表现在：1.早期诊断，PCR 扩增极其敏感，理论上在感染潜伏期即可检出。2.灵敏度高，对部分乙肝患者体内的病毒长期低复制感染，血清病毒浓度极低，一般酶标试剂无法检出，可以通过PCR法检出。3.疗效跟踪及病程判断，PCR技术能定量检测乙肝病毒基因，为指导临床用药提供依据。
目前,性传播疾病(STD)已成为威胁人们健康的主要问题之一.除AIDS外,人乳头瘤病毒(HPV),单纯疱疹病毒(HSV),沙眼衣原体(CT)也 是引起STD的常见病原体.尽管目前已有多种检测方法,但大多比较费时且检测灵敏度不够高. 现存检测方法的不足主要表现为对细菌、寄生虫等病原体主要使用镜检的方法，这种分法很容易漏检；对支原体、衣原体等采用培养法检测，人所共知培养法不仅费时、价格昂贵而且受到采样、因药治疗情况等多种因素影响，敏感度出不高等。PCR法的出现为STD检测提供了一个可靠的检验方法。PCR法直接检测病原体基因是最直接的感染证据，并且简单快速可以在数小时内得到明确的结果。PCR法的高敏感性，可以把目的基因片段在短短的数小时内扩增至数万倍以上，因此不易造成漏诊，这在病人感染的极早期或潜伏期的诊断有相当重要的意义。
呼吸道感染是指病原体感染人体的鼻腔、咽喉、气管和支气管等呼吸系统，分为上呼吸道感染和下呼吸道感染。常见的呼吸道病原体主要有病毒、细菌、支原体、衣原体和立克次体等。由细菌引起呼吸道感染机会比病毒少，但感染后的症状多较严重，主要病症为扁桃体炎、中耳炎、鼻窦炎等。由细菌引起的儿童肺炎是流感嗜血杆菌、肺炎链球菌或金黄色葡萄球菌。引起呼吸道感染的病毒包括鼻病毒、冠病毒、呼吸道合胞病毒、流感病毒、副流感病毒、腺病毒等。支原体、衣原体感染导致的早期临床表现与其他病原体感染类似。在小于30岁的年轻人中，肺炎支原体是最重要的下呼吸道病原体。PCR以其操作简便、灵敏度高、特异性强等特点，能筛查确诊早期患者感染病原体，提供对症用药指导，在呼吸道病原体检测方面有着广泛应用。